A Tokaji Múzeum a város főterén, egykor itt élt görög bortermelő család 1790 táján építtetett házában működik. A műemléképület minden szintjén kiállítás várja a vendégeket, melyekből egy kis ízelítő:
„Rejtett kincsek a Tokaji Múzeum gyűjteményéből”:
A múzeum emeleti kiállítóterét megtöltik az oklevelek, utazóládák, vas városládák, amelyek eddig a raktárakban pihentek. A tárgyak, pergamenek között sétálva Tokaj város több mint 900 éves múltja követhető vissza. „Vinum regnum, rex vinorum” – királyok bora, borok királya, így hangzik a XIV. Lajos francia királynak tulajdonított mondás. A teljes akkor ismert világ asztalán helyet kapott a méltán híres tokaji bor. Kereskedelme azonban nem valósulhatott volna meg a megfelelő engedélyek, kiváltságlevelek hiányában, amelyekből több is látható a tárlaton.
„Kincses padlás” – néprajzi látványtár:
A múzeum padlásterében kiállított, több ezer darabos tárgyi anyag Makoldi Sándor festőművész és tokaji születésű felesége, Makoldi Sándorné Papp Gizella magángyűjteménye, amely a történelmi Magyarország egész területét és a hagyományos néprajz minden szegletét felöleli.
Béres Béla egyházművészeti gyűjteménye: Béres Béla esperes 1981-ben a múzeumnak adományozta közel 800 darabos gyűjteményét, amely téma szerint két részre különül. A tárgyak egy része az észak-magyarországi népies barokk egyházművészetet reprezentálja, míg a kollekció többi darabja a hazai bizáncias művészetről mesél. A két átfogó kategórián kívül is találunk érdekes emlékeket a múzeumban, ilyenek például a német ősnyomtatványok vagy a nagyszombati nyomdából kikerült relikviák.
Múzeumkert - Kőtár: A múzeumhoz tartozik egy különleges növényekkel betelepített kert és kőtár, mely aktív szerepet vállal a bemutatókon, koncerteken és kiállítás-megnyitókon.